该发明实施例公开了一种基于3D显微镜图像的裸眼3D显示系统及其方法,系统包括图像采集设备,裸眼3D显示设备,多个体域网,多个体域网协调器,多个移动终端,一个服务器以及至少一个处理终端;显示设备显示图像采集设备传送的3D显微镜图像,移动终端通过体域网协调器获取体域网采集的身体信息,服务器根据身体信息构建数据库,处理终端根据数据查询请求,调用数据库以得到可视化信息.实施本发明实施例,提升了用户对3D显微镜图像的视觉效果,同时可对多个待测用户健康状况的监测,还能对身体信息构建的数据库进行处理以得到可视化信息,并进行可视化展示.